韦恩庄园在烈火中化为灰烬，可高谭市的邪恶势力，也同样受创不轻。表面，布鲁斯·韦恩（克里斯蒂安·贝尔）还是那个香车美女、家财万贯的亿万富翁，私底下，戴上蝙蝠侠面具的他，誓将穷街陋巷中残余恶匪一网打尽。有警长戈登（加里·奥德曼）和新上任的地区检察官哈维·丹特（亚伦·艾克哈特）的协助，曾经只能孤身犯险的黑暗侠客，更加如虎添翼。几大正义势力联手惩恶锄123，暴力不断的高谭市渐渐回复了昔日的平静，而希望终有一日可以摆脱双面生活的蝙蝠侠，似乎也终于有了机会可以和青梅竹马的蕾切尔（麦姬·吉伦哈尔）双宿双飞。
然而，平静的表面之下，暗藏着腥风血雨。黑帮头目法尔肯被关进疯人院之后，又迎来了新的首领，势力越渐扩张；黑夜之中，无数伪装成蝙蝠侠的冒牌货横行，公众对这位面具侠客心存忌惮；腐败警察与治安组织，对蝙蝠侠暗自怀恨；发现布鲁斯真实身份的疯狂记者，欲揭穿他的秘密；更可怕的是，一股新的犯罪势力正悄悄滋生......
抢银行、捣乱警局、炸毁医院、残杀无辜市民、甚至公开闯入电视台发布死亡威胁，一个邪恶乖戾号称“小丑”（希斯·莱杰）的家伙，带着他的小丑军团大肆席卷高谭市，烧杀抢掠无恶不作。气焰嚣张的小丑的终极目标，正是蝙蝠侠！这个智商超高、誓要将高谭市变为水深火热地狱的坏蛋头子，到底有着怎样的计划？而本属黑暗的蝙蝠骑士，又会不会因此被逼上正邪的边缘